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Scientific Agent Skills:142 个 Skill 让 AI Agent 变成 AI Scientist

27k Star,覆盖基因组学到药物发现的 16 个科研领域、100+ 科学数据库,全球 16 万科研人员在用

2026/6/80 次阅读
#AI Skill#Claude Code#科研#生物信息#药物发现
Scientific Agent Skills:142 个 Skill 让 AI Agent 变成 AI Scientist

做科研最耗时的不是想 idea,是执行。查数据库、调 API、写分析脚本、画图、排版——每个环节都要翻文档、踩坑、重写。一个熟练的博后跑完一个分析流程可能要三天。Scientific Agent Skills 把这些流程变成了 Skill,Agent 几分钟跑完。

142 个 Skill 覆盖什么

这不是一两个方向的小工具集。16 个科研领域、142 个 Skill,几乎覆盖了生命科学和物理科学的全部常用分析流程:

生物和医学:基因组序列分析、单细胞 RNA-seq(Scanpy)、基因调控网络、变异注释、蛋白质结构预测、分子对接(RDKit)、ADMET 药物毒性分析、临床试验检索、EHR 分析、DICOM 医学影像处理、全切片数字病理分析。

物理和工程:天文数据处理、晶体结构分析、分子动力学(OpenMM)、量子计算(Qiskit/PennyLane)、离散事件仿真、多目标优化。

数据和方法:时间序列预测(TimesFM)、深度学习(PyTorch Lightning)、贝叶斯方法、网络分析、空间统计、卫星图像处理。

科学传播:文献综述、同行评审模拟、科学写作、海报制作、幻灯片生成。

100+ 科学数据库一键查询

这是最实用的部分。一个统一的数据库查询 Skill 直接访问 78 个公开数据库:

  • 生物:PubChem、ChEMBL、UniProt、COSMIC、ClinVar、PDB
  • 临床:ClinicalTrials.gov、DrugBank、PharmGKB
  • 基因组:BioServices(40 个服务)、BioPython(38 个 NCBI 子库)、gget(20+ 数据库)
  • 其他:FRED(经济)、USPTO(专利)、DepMap(癌症依赖)

以前你得自己去每个数据库的网站查文档、学 API、调参数。现在跟 Agent 说「查 PubChem 里这个化合物的 ADMET 性质」,它自己知道怎么查。

实际使用场景

药物发现:虚拟筛选 → 分子性质预测 → ADMET 分析 → 分子对接 → 先导优化,全流程一条 prompt。

基因组分析:序列获取 → 比对 → 变异注释 → 功能预测 → 可视化,从 raw data 到 publication-ready figures。

临床研究:ClinicalTrials.gov 检索 → 患者队列筛选 → 统计分析 → 生成临床决策支持报告。

安装

npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills

一条命令,142 个 Skill + 100+ 数据库接口全部到位。

和 nature-skills 的关系

nature-skills(17k Star)侧重论文写作和表达——学术润色、审稿模拟、引用管理、科研绘图。Scientific Agent Skills 侧重科研分析和执行——数据库查询、分子对接、基因组分析、机器学习。一个帮你写论文,一个帮你做研究。一起用就是完整的科研工作流。

作者

K-Dense Inc.,专注 AI for Science。MIT License。